Tag Archives: Labbet

Bra år för biohacking

Nu när vi börjar närma oss slutet på år 2016 har det blivit dags att sammanfatta året. Det är många som kallar 2016 för ett av de sämsta åren på länge, men för biohacking-rörelsen i Sverige har det varit ett bra år. Här är några av höjd-punkterna.

Biohacking-konferens. Vi höll Sveriges första biohacking-konferens i april i år som blev superlyckat. Under konferensen kunde 200 besökare lyssna på både inhemska och internationella talare berätta om alltifrån bodyhacking till DNA-analysmaskiner och cyborger.

Chipfester. Vi hade en mängd events där ännu fler människor skaffade chippen och nu känner jag mig säker på att svenskarna är de mest chippade folket per capita i världen. Vi chippade både på öppna events och stängda företag-events. Intresset är fortsatt stor för chippen och tillämpningarna börjar komma sakta men säkert. Vi jobbar på att fler ska kunna få chippen och även för fler tillämpningar. Speciellt vill vi under nästa år satsa på att nå ut till de delar av landet som inte tillhör storstadsregionerna och introducera minst en till användbar praktisk tillämpning.

Labbet. Jag skulle utan tvekan säga att biolabbet på Makerspace varit den grenen av svensk biohacking som utvecklades mest under 2016. Allt som hänt i labbet skulle kunna bli ett eget blogginlägg men här kommer istället en snabb sammanfattning: Vi var en grupp som samlades ganska direkt efter biohackingkonferensen och bestämde oss för att prova på PCR. Vi fick lite DNA från en kontakt på Stockholms universitet och började testa och testen gick bra. Under sommaren gjordes det två reportage i svensk media om biolabbet. Dels i Svenska Dagbladet och dels i SVT Rapport. Vi höll därför ett öppet hus för att alla nyfikna efter dessa reportage skulle få se labbet och det dök upp runt 40-50 personer mitt i juli under den initiala Pokémon Go hajpen. Under hösten genomförde vi en workshop-serie i tre delar som del i ett samarbete med iGEM Stockholm där deltagarna under tre workshops fick lära sig att pipettera, tekniker för att odla bakterier och till slut även försöka modifiera bakterier till att börja fluorescera. Vi lyckades inte få fluorescerande bakterier vi det tillfället, men vi lyckades vid ett annat tillfälle när vi testade själva. Strax efter det lyckade försöket lyckades en av medlemmarna även med att analysera en gen med PCR-tekniken. Efter det körde vi workshop-serien ytterligare vid ett tillfälle och är inne på den tredje omgången nu.

Till nästa år planerar vi att köra en CRISPR-workshop, en PCR-workshop och vi kommer även starta upp ett riktigt projekt.

Oavsett projekt känns det som att rörelsen i Sverige börjar få upp bra momentum nu. Vilket betyder att nästa år kommer bli riktigt bra på sätt som jag inte kan föreställa mig eller vill spekulera i. Men om man är intresserad av att följa med i rörelsens utveckling så rekommenderar jag följande sociala medier: Chipster på Facebook, Stockholm Makerspace biolabbet-gruppen på Facebook och nystartade Biohacking.se på Facebook för generella nyhetsuppdateringar kring biohacking-rörelsen. Jag startar en Facebook-sida för biohacking.se för det kommer så många intressanta nyheter ur den här globala rörelsen varje vecka men som inte når tillräckligt många i Sverige eftersom det inte finns bra sätt att sprida nyheterna. Så om du vill hålla dig uppdaterad ska du följa den sidan. Jag får dock flagga för att i skrivande stund är den Facebooksidan fortfarande i uppstartsfasen och är väldigt tom just nu.

Vi syns och hörs på andra sidan året till det året som förhoppningsvis blir ännu bättre än vad det här året var.

Snart kommer workshopen i biolabbet

Nu är vi snart där! Saker börjar falla på plats och vi kommer börja köra workshopen i augusti. Om du vill vara med och lära dig att labba så finns nu ett formulär där du kan anmäla ditt intresse för att vara med. Det är bra för oss att se hur många som vill vara med så vi kan planera bättre. Så anmäl er om ni vill testa på att labba. När vi har satt datumen för workshopen skickar vi ut mer information om dem.

Man bör välja de två första workshopen om man inte har någon tidigare erfarenhet av att labba. Men ingen av workshopen kräver några förkunskaper.

Dessa workshops ger Stockholm Makerspace i samarbete med Stockholms laget i iGEM-tävlingen.

Genombrott i labbet!

Sen biohackingkonferensen har jag samlat en grupp personer som visat extra mycket intresse för labbet och vi träffas med jämna mellanrum och försöker kickstarta verksamheten i labbet. Första gången vi träffades för att labba på riktigt var på Kristihimmelsfärdsdagen då vi försökte genomföra hela processen med att analysera DNA med PCR-tekniken. Målet var att testa om utrustningen fungerade. För att göra detta bestämde vi oss för att strunta i de första stegen med att designa primers och extrahera DNA. Jag bad en kontakt på Stockholms universitet om vi kunde få lite bakterie-DNA och primers och det var inga problem. Vi fick lite leftover plasmider med tillhörande primers. Vi satte igång med att använda PCR-maskinen för att kopiera upp plasmiderna. Vi kom till sista steget som är elektroforessteget innan jag insåg att vi saknade den DNA-färg som krävs för att kunna genomföra det steget.

En jakt började för att få tag i denna typ av färg, som inte är helt lätt att få tag i om man är ett biohackerlabb i Sverige då priset är riktigt saftigt. Jag skrev upp Makerspace som kund på bioteknikföretaget VWR för de hade det billigaste priset. Den processen i sig tog nästan två veckor. Men precis innan jag skulle köpa in färgen kom jag i kontakt med en forskare på Örebro-universitet och efter lite diskussioner erbjöd han sig att skicka exakt den färgen vi behövde, och helt gratis för oss på Makerspace! Väldigt hyggligt! Jag måste säga att stödet vi har fått från enskilda forskare på svenska universitet har varit fantastiskt och helt ovärderligt.

2016-05-25 19.10.27

Paketet tog jag med mig (under kylning!) till Makerspace och vi träffades på nytt på nationaldagen för att fortsätta testet, bara för att inse att färgen vi hade fått inte var anpassat för vanlig PCR. Den var anpassad för det som kallas för RT-PCR, vilket jag visste från början. Det jag inte visste var att man använder olika koncentrationer av färgen för PCR respektive för RT-PCR. För RT-PCR används en 10x-koncentration och för PCR används en 10,000x-koncentration. Stor skillnad. Det hade inte gått att anpassa 10x-koncentrationen för vårt syfte genom att blanda det med gelen som man ofta gör. Men idén dök upp att blanda 10x-koncentrationen med proverna innan de sattes på gelen. Enligt instruktionerna skulle det funka att göra det på det sättet så vi bestämde oss för att testa den vägen. Vi mixade ihop allting och slängde upp (in?) proverna på gelen.

2016-06-06 12.28.47

Tjugo minuter senare kunde vi se resultatet på transilluminatorn. Det lyckades! Plasmiderna hade kopierats upp och proverna hade färgats trots att vi inte hade rätt koncentration. På bilden nedan är de ljusgröna kvadraten DNAt som kopierats upp. De med bra kunskaper och erfarenhet av PCR kan se att stegen till vänster inte har fått rätt upplösning och det är en grej vi får jobba på att lösa. Det viktiga just denna gång var att visa att PCR-maskinen fungerar och att SYBR Green (som färgen heter) fungerar med blått ljus. Vilket vi också gjorde. Som ett plus vet vi nu också att vi kan förfärga proverna innan de sätts på gelen.

2016-06-06 13.09.32

Slutsatserna av allt det här arbetet är att den grundläggande tekniken för att analysera DNA nu finns på Stockholm Makerspace och fungerar! Nästa steg blir att justera resultaten och få rätt upplösning på stegen. Parallellt måste vi hitta en metod för att extrahera DNA, designa primers och hitta någonstans att beställa från. Efter det kan vi börja jobba med andra organismers DNA.

Labbets status under våren

Under början av året gav jag ett löfte att satsa mer på biolabbet som finns på Stockholm Makerspace. Sedan dess har jag samlat ett par personer som visat stort intresse att driva projekt aktivt i labbet så att vi gemensamt kan jobba på att gå igång verksamheten i labbet. Målet är att få genomföra en PCR-analys. Vi har hittills träffats två gånger i labbet. Den första gången gick vi genom hur PCR funkar och vi listade ett par projekt som vi möjligen skulle kunna genomföra. Andra gången bestämde vi oss för att genomföra ett test av en gen som bestämmer om man kan känna av den bittra smaken som kallas för PTC och vi röjde undan mycket skräp som låg i labbet.

2016-04-13 21.51.35

Vi bestämde även att vi den 5e maj ska genomföra ett testförsök av utrustningen för att se om de funkar. För det testet kommer vi få plasmid-DNA och primers av en kontakt på Stockholms universitet. På det sättet slipper vi steget med att extrahera DNA. Då vet vi säkert att det åtminstone finns DNA i provet om det blir nåt problem med resultatet.

Så just nu pågår förberedelser inför 5e maj. DNA och plasmider ska hämtas från SU, protokollet för analysen ska färdigställas, skräp måste slängas, eventuellt måste en våg köpas in osv. Om man vill hjälpa till med att gå igång labbet kan man börja med att börja följa biolabbets Facebook-grupp som vi använder för att kommunicera på, eller så kan man kontakt mig för mer information.

Liten uppdatering av vad som händer just nu

Tänkte bara skriva lite om vad och vilka projekt jag håller på med just nu.

Labbet
Jobbar fortfarande på att få PCR-protokollet att fungera. Det senaste är att jag har kört PCR på mitt eget DNA. Men medan jag höll på att lägga en gel för att kolla på resultatet så smällde spänningslådan. Så nu ligger mitt DNA på is (bokstavligt talat) medans jag väntar på att den nya spänningslådan jag beställt ska anlända. Sen ska jag kollar resultatet. Om det är bra så börjar jag planera för workshops. Om det är dåligt så gäller det att göra om och göra rätt.

Brainhacking
Bygger just nu på version två av tDCS-lådan jag byggde förra året. Det är tänkt att denna ska vara så bra att om man vill köpa en så ska det vara möjligt. Arbetet fortskrider sakta men säkert framåt. Borde kunna ha en fungerade version i år. Största problemet med att sälja dem är att jag inte är insatt i alla konsumtrelaterade lagar och regler. Bara att läsa på dem kommer nog ta hela jullovet. Så förvänta er att denna nya version kommer finnas för försäljning någon gång i början av nästa år. Kan tänka mig slänga ihop en allmän brainhacking-meetup med denna nya tDCS och en del andra hjärn- och neuroprylar som man kan testa på.

Chip
Det är många som anmäler intresse för chip via chipster.nu. Så vi planerade in ett event som skulle ha ägt rum förra fredagen i Stockholm. Men vi behövde förskottsbetalningar för vi behövde kunna säga till vår piercare att det hade varit värt hans resa och tid. Men antalet förskottsbetalningar kom inte in i den takten som var nödvändigt, så för att inte riskera nåt ställde vi in eventet. Det intressanta är att efter att eventet ställdes in har jag fått massor med frågor om när vi omplanerar chip-eventet. Så jag kommer göra ett nytt försök efter julledigheten, troligen i slutet av januari, med ett nytt event. Då lägger jag upp det så att om vi lyckas få in X antal förskottsbetalningar inom 24 timmar så ordnar vi ett event.

Övrigt
Bionyfiken blev beviljad pengar för att anordna en konferens för biohackers/makers och vi kommer börja planera för den. Vi hoppas kunna hålla den under våren nästa år. Kommer också börja skissa för Bionyfikens eller biolabbets medverkan på teknikfestivalen Tekla som hålls för unga tjejer under våren.

Höstens planer för Bionyfiken och Stockholm Makerspace

Vi är i fullfärd med att planera hösten både för Bionyfiken och Stockholm Makerspace. Här är en liten sammanfattning av vad som händer under hösten för båda föreningarna.

Stockholm Makerspace
Det största som kommer hända på Makerspace under hösten är att den nya lokalen kommer invigas. Datum för invigningen kommer högst troligen bestämmas under nästa styrelsemöte som är på måndag nästa vecka. Räkna med ett antal talare, rundvisningar, visning av medlemsprojekt och massa intressanta samtal.

Sedan kommer det troligtvis hållas en hel del workshops. PCR-workshoppen är riktigt nära nu. Där behöver jag bara inhandla vårvaran och köra en del tester. Just nu är jag i samtal med 3-4 olika företag om att inhandla den våtvara som behövs. När pappersarbetet där är klart är det bara att köra igång med inhandlandet. Självklart blir det massa workshops i de övriga delarna av spacet också.

Bionyfiken
På Bionyfiken håller vi på att planera in en hel del talarkvällar. Minst en i månaden hela hösten. Alla ämnen har självklart stark koppling till biohackingens olika grenar.

Sedan kommer en del meetups i brain/neuro-hacking, vi jobbar hårt för att kunna arrangera chip-events över hela Sverige (om du vill ha ett chip kan du anmäla ditt intresse på chipster.nu) och vi kommer dyka upp på en del konferenser och liknande under hösten (till exempel på Nörd Café på Tekniska Museet). Om det så finns önskemål om det kan vi även arrangera öppna kvällar där vi som biohackare bara samlas och snackar senaste forskningen, coolaste hacken och hittar på nya projekt.

Vill du vara med på och hjälpa till kan du skicka ett mail till mig. Vill du hålla dig uppdaterad om vad som händer kan du forsätta följa denna blogg eller lika Bionyfiken på Facebook. Vill du veta när vi arrangerar nästa event ska du gå med i meetup-gruppen.

Reportage i DN om biohacking

DN har idag publicerat ett längre reportage om biohacking som är värt att läsa. I samband med artikeln gjordes en interjuv med mig och en fotograf från DN var med när vi flyttade in labbprylar vi hade fått i donation från ett företag. Artikeln ger i all väsentlighet en korrekt och rättvis bild av rörelsen. Men jag har några mindre kommentarer.

en hackare någon som bygger om, experimenterar och skapar nytt inom datorteknik. Biohackaren vill göra samma sak, men med organisk materia i stället för kretskort och kod.

Jag skulle nog säga att de typer av biohackare som jobbar med bakterier och DNA snarare använder DNA och bakterier som datorhackare använder datorer, kretskort och kod. Det är dit vi är på väg. En framtid där vi använder organiska maskiner som datorer och kretskort och där vi skriver kod med DNA (och bygger abstrakta lager för att göra det lättare att koda).

Men i sin enkelhet sätter det fingret på en viktig sida av biohackerkulturen: Drömmen om cyborgen, den biologiska kroppen i symbios med tekniken, syntesen mellan människa och maskin. Tankeströmningen brukar kallas transhumanism, idén att det är både möjligt och lämpligt för mänskligheten att förändra och vidareutveckla våra fysiska kroppar.

Det stämmer att många biohackers vill förbättra människans biologi och drömmer om symbios mellan människa och andra teknologier som robotteknologi. Men det finns också många vill skilja mellan biohacking och transhumanism, där biohacking är leka med biologi för sakens skull och transhumanism är drömmen om den biologisk och tekniskt förbättrade människan för sakens skull. Uppenbart är det att det är svårt att skilja dessa rörelser åt från varandra och att människorna i de två olika rörelserna gillar varandra och varandras idéer. Jag ser heller inget problem med den grejen eller att rörelserna överlappar.

I övrigt tycker jag att det är märkligt att Roger Roffey, forsknings­ledare på Totalförsvarets forskningsinstitut, FOI i artikeln utgår ifrån det värsta. Självklart tar vi seriöst på säkerheten. Säkerhetsarbetet är en av de största komponenterna i det här projektet. Besöker man vår verksamhet sen när vi har öppnat portarna och lär sig lite om vilka vi är och vad vi gör kommer det vara helt uppenbart att inget farligt kommer ske i den lokalen.

Är man i övrigt intresserad av labbet och kanske själv vill komma och lära sig rekommenderar jag att man blir medlem i Makerspace när den nya lokalen väl har invigts. Man kan också bli medlem i Bionyfiken om man vill ge stöd för fortsatt utveckling av biohackingrörelsen i Sverige. Håll även koll på vår meetup-grupp för kommande events. Har ni några frågor kan ni alltid maila.

Hjälp oss flytta labbutrustning

För några veckor sedan fick vi möjligheten att besöka ett företagslabb och ta vad vi ville av utrustningen och möblerna eftersom företaget skulle lämna lokalen. Vi har varit där vid två tillfällen och samlat på oss en lagom mängd grejer. Nu måste vi transportera dessa saker till labbet. För att göra det kommer vi ordna med flyttlådor och papper för att skydda de mest ömtåliga sakerna och packa ned dem i lådorna. Vi kommer även ordna en skåpbil som kör prylarna till labbet.

Men vi behöver hjälp med att packa ned grejerna i kartongerna och flytta ned dem till entréplanen (hiss finns) där skåpbilen kommer stå, och vi behöver hjälp med att packa in sakerna i bilen.

Transporten av sakerna ska samordnas med städningen av Makerspace på Wallingatan och måste därför göras nu på onsdag den 15:e. Vi börjar kring kl 17-18. Grejerna vi samlat på oss är väldigt viktiga för driften av ett labb så vi skulle uppskatta all hjälp vi kan få. Det är bara att dyka upp om man kan hjälpa till. Adressen är Torsgatan 26. Denna information kan även hittas på vår meetup-grupp.

Nedan finns två bilder på en del av grejerna vi samlat på oss.

2015-04-09 18.35.50

2015-04-09 18.35.40

Invald i Stockholm Makerspace-styrelse

Var ett tag sedan jag skrev något här. Men det har inte direkt varit brist på grejer som hänt under tiden. Arbetet med att bygga labbet har fortsatt och är nu är labbet helt färdigbyggt. Nu gäller det bara att fylla det med prylar och den första april får vi börja bedriva verksamhet i labbet (i övriga Makerspace får verksamheten dra igång 1 maj). Förutom att det redan finns en hel del labbprylar i labbet så har vi från Bionyfiken skaffat en openPCR som vi kommer flytta in till labbet snart. Och vi har även fått en hel del andra intressanta erbjudanden om labbprylar. Förhoppningsvis kan vi ordna ett våtlabbsevent redan under april.

Förutom byggandet av nya Stockholm Makerspace är den andra intressanta händelsen att föreningen hade sitt årsmöte tidigare idag där en ny styrelse valdes och som jag är en del av nu. Jag kommer sitta som en ledamot i styrelsen. Jag ser framemot att vara med och utveckla makerrörelsen i Stockholm men även resten av Sverige. Jag fokuserar gärna på tillväxt av Stockholm Makerspace nu när ekonomin för föreningen ser väldigt bra ut efter år av ekonomiska svårigheter. Jag vill också fokusera på att introducera biohacking för gräsrötterna i svenska makerrörelsen. Jag ser gärna att det om ett par år finns en inkubator likt THINGS som helt och hållet fokserar på syntetisk biologi och andra framtidstekniker inom bioteknik.

Avslutar med några bilder på hur labbet ser ut just nu.

2015-03-25 18.54.49

2015-03-25 18.55.20