Tag Archives: iGEM Stockholm

Paneldebatt om etiken med att modifiera liv

Det finns en internationell tävling i biologi som kallas International Genetically Engineered Machine där studenter från olika universitet runt om i världen tävlar mot varandra i syntetisk biologi och samtidigt bygger en databas av biologiska komponenter. Det är en vänskaplig tävling som sträcker sig bortom naturvetenskap och därför bjuder iGEM Stockholm och iGEM Uppsala till en paneldebatt den 14e september i Stockholm med titeln The Ethics of Engineering Life. Det är gratis inträde och det bjuds på fika. Läs mer på eventsidan på Facebook och anmäl dig på Eventbrite!

Vad som händer just nu

Det var länge sedan jag skrev här. Inte för att det inte händer nåt men för att det har hänt för mycket senaste tiden. Här är ett svep av vad som har hänt senaste månaden.

iGEM 2017. Jag har gått med i årets Stockholms lag i iGEM. Det är det som har tagit mest tid senaste månaden. Ser fram emot hela resan. Kommer bli intensivt men roligt och väldigt lärorikt. Kommer blogg om de mer roligare delarna under resans gång.

Labbet. Arbetet i labbet har gått lite segare sedan årsskiftet, men det finns en plan. Vi fokuserar på hårdvara just nu. Speciellt behöver vi en skakare och försöker bygga en själva. Parallellt ska vi lära oss att transformera E.coli-bakterier och jag håller på att kolla på några protokoll för detta. Om man är intresserad av det pågående labbarbetet kan man gå med i denna Facebookgrupp.

tDCS. Jobbet med att börja bygga en säljbar version av tDCSen har kommit igång på allvar. Siktar fortfarande på mars för de första beta-versionerna och behöver då ett par personer som testar dem och kommer med feedback. Jag vet att det finns många som redan är intresserade.

Chippen. Fortfarande är intresset stort för chippen 🙂

Övriga nyheter i snabbhet från biohacker och bioteknik-världen är företaget Illumina annonserar att maskinen som en dag väntas kunna sekvensera ett helt genom för $100 har byggts, Tyskland hotar biohackare med fängelse om de inte följer lagen och Open qPCR lanserar fullständiga källan för en Real Time PCR-maskin (både hårdvaruritningar och mjukvara). Om du vill ha snabbare uppdatering av nyheter om vad som händer i biohackingkretsar och annan spännande bioteknik nyheter så rekommenderar jag nya Facebooksidan för biohacking.se. Uppdateringar kommer ske snabbare där.

Vi skapade bakterier som lyser!

Dåså! Vi har länge pratat om det. Nu äntligen lyckades vi modifiera DNAt för E.coli-bakterier så att bakterierna började lysa!

Vi sa för flera månader sen att vi skulle göra det här experimentet i samarbete med iGEM Stockholm under en workshop. Denna workshop höll vi i söndags förrförra veckan (16e oktober). Tyvärr lyckades vi inte få några lysande bakterier då. Men i söndags förra veckan (23e oktober) var vi ett litet gäng nere på Makerspace för att försöka igen. Jag såg ganska direkt vad vi hade gjort för fel första gången. Bakterierna från orginalprovet hade klumpat sig i botten av Eppendorf-tuben så vi hade troligen inte fått med några bakterier alls första gången. Vi gav bakterierna även längre tid på sig att uttrycka antibiotika-resistenta genen. Det löste problemet och nedan kan man se resultatet av de lysande bakterierna.

14720509_10211208214631366_7865233755866036062_n

Om man själv vill testa på att modifiera bakterier så kommer vi köra denna workshop igen nästa månad. Håll ögon och öron öppna på Facebook.

Dags att anmäla sig till workshops i biolabbet

Det har tagit en lång tid att komma hit. Resa har varit lång. För mig började den till och med innan vi startade Bionyfiken. Men de senaste två åren har vi jobbat hårt. Tack vare Stockholm Makerspace lyckades vi bygga upp Sveriges första öppna biolabb och nu kan vi tack vare samarbetet med iGEM Stockholm börja lära människor grundläggande labbteknik. Det här är början på en ny fas. Saker kommer definitivt bli mycket mer intressanta från och med nu.

Vi har i flera månader jobbat med iGEM Stockholm för att kunna ge en uppsättning workshops där vi lär ut grunderna för olika vanliga tekniker som man använder i biolabbar. Det är tre olika workshops och vi vill att man gör de två första för att man ska få göra den tredje. Och det är helt enkelt för att den tredje är lite mer avancerad och de två första lägger grunderna för den tredje.

Nedan följer information man behöver veta för att kunna vara med på workshopen och beskrivning av varje workshop.

  • Man måste vara medlem på Stockholm Makerspace för att kunna gå workshopen. Det är en avgift på 200 kr per år. Man kan betala avgiften och bli medlem här.
  • Man måste vara 16 år för att bli medlem på Stockholm Makerspace och för att få gå på dessa workshops.
  • Det tillkommer en avgift på mellan 100-200 kr för varje workshop. Denna avgift går uteslutande till inköp av material och utrustning som behövs för workshopen
  • För de två första workshopen kan man välja om man vill göra dem på förmiddagen eller på eftermiddagen. Så dubbelkolla vilken tid du bokar.
  • För att göra den tredje workshopen måste man ha gjort de två första.

Pipettering och mikroskopi.
Datum för workshop: 2a oktober
Anmälan: Kl 10-13 eller kl 14-17.
Avgift: 100kr
Antal platser: 32 stycken

Pipettering är nåt man gör hela tiden i ett biolabb. Det är inte speciellt svårt men man behöver ha gjort det ett par gånger för att få en känsla för det. Det finns också en del olika saker att tänka på vid olika situationer. En biohackare behöver kunna hantera sin pipett som en snickare hanterar sin hammare. Deltagarna får testa på att pipettera karamellfärg i serier dels för att få känsla för pipettering och dels lära sig seriespäda. En spektrofotometer används för att bekräfta resultaten.

Mikroskopet är ett landmärke inom bioteknik. Även om det gamla klassiska ljusmikroskop inte används så mycket längre inom forskning kan man fortfarande använda dem för enkel karakterisering av biologiska mikrostrukturer så som bakterier.

Det blir även en teoretisk introduktion och en genomgång av säkerhet i labbet.

Odla bakterier
Datum för workshop: 9e oktober
Anmälan: Kl 10-13 eller 14-17.
Avgift: 200 kr
Antal platser: 32 stycken

Bakterier är bioteknikens arbetshästar eller dess mikroprocessorer om man så vill. När man vet vad man vill göra använder man ofta bakterier för att få jobbet gjort. Det är därför viktigt att kunna odla bakterier så effektivt som möjligt och det finns en del tekniker för att få jobbet gjort. I den här workshopen får deltagarna gå ut och ta sina egna prover från naturen. Sedan odlar man dessa på egen förberedd näringslösning. Det kommer finnas möjlighet att kommta tillbaka dagen efter för att kolla på resultaten. Annars postar vi bilder av resultaten på internet. Teori ingår såklart.

Programmera lysande bakterier
Datum för workshop: 16e oktober
Anmälan: Kommer senare
Avgift: Kommer senare
Antal Kommer senare
Övrigt: De två första workshopen måste ha genomförts för att man ska få göra denna.

I den sista workshopen får deltagarna testa på det som är grunden för det som kallas syntetisk biologi. Syntetisk biologi är programmering för biologi och används för att programmera bakterier och andra celler att göra det man programmerar in i deras genetiska kod. För att demonstrera tekniken kommer vi koda bakterier till att bli självlysande i blått- eller ultraviolettljus.

iGEM Stockholm

iGEM är en internationell tävling i (framförallt) syntetisk biologi för gymnasieelever, högskolestudenter och biohacking- och communitylabbar runt om i världen. I Stockholm finns det ett lag med studenter från KTH, KI och Konstfack. Tävlingen avgörs i en stor final som hålls i Boston i USA i slutet av oktober. Dessa workshops har utformats och arrangeras i samarbete med iGEM Stockholm. Eftersom de behöver presentera resultaten av sina insatser i att utforma dessa workshops måste de arrangeras så snart som möjligt så att laget hinner skriva ned resultaten. Det är därför de arrangeras med kort varsel. Men vi vill gärna ställa upp för iGEM Stockholm när de ändå tog på sig att utforma tre stycken separata kvalitativa workshops åt oss. Vi hoppas ni har överseende med detta.

Hjälp till att skicka Stockholm iGEM till Boston

Det finns en internationell tävling i biologi som kallas för International Genetically Engineered Machine. Tävlingen går ut på att lag (ofta bestående av högskolestudenter) tävlar i den del av biologi som kallas syntetisk biologi. Syntetisk biologi handlar om att skapa biologisk system som inte finns naturligt (tänk självlysande yoghurt). Tävlingen har funnits i över 10 år och går helt enkelt ut på att skapa nya biologiska system med standardiserade biologiska delar och delar som varje lag själva bygger. Alla lag jobbar över sommaren i sina hemlabbar och åker sedan till Boston i USA och tävlar med sina respektive projekt i den stora slutfinalen. iGEM-tävlingen har bidragit stort till att bygga ett bibliotek av standardiserade biologiska delar.

Sverige har i flera åt haft deltagande lag i tävlingen. Men jag tror inte att vi har haft så många lag från Sverige som deltagit i tävlingen som i år. Dessutom har vi ett riktigt ambitiöst lag från Stockholm i år som bygger ett bakteriesystem som ska kunna detektera sjukdomar med hjälp av en teknologi som kallas för Affibody och som utvecklats vid KTH. Det är så ambitiöst som det låter!

Stockholm iGEM logo

Stockholm iGEM logo

Det finns bara ett problem. De deltagande måste finansiera alla kostnader själva. Hittills har Stockholms laget fått in en hel del sponsorer som sponsrat med både utrustning och pengar. Men för att kunna färdigställa projektet och ta sig hela vägen till Boston behöver de lite mer och har därför dragit igång en crowdfundingkampanj för att få in de sista slantarna som behövs. Det är bara 52% kvar tills de når målet. Vill du hjälpa till att driva biologisk forskning på ett konkret sätt och hjälpa ett gäng studenter som kommer vara i labbet och kämpa hela sommaren medans vi andra ligger på stranden och trycker glass? Donera vad du kan i denna kampanj, varje krona kommer hjälpa. Jag har redan donerat, gör det du också!